En 1945 se inauguran las “Escuelas Gratuitas o Instituto San Juan Bosco en el costado occidental del Templo. La construcción empezó hacia 1942 poco antes de la creación de la Parroquia. Estas escuelas hacían parte de una gran idea planteaba el Padre Juan en cuanto al bienestar de los jóvenes. Se puede hablar de una “ciudadela” que comprendían las Granjas, los talleres y la sección educativa, la educación era de carácter mixta.

Para la educación de las niñas el Padre Juan adquirió un local en donde conformo lo que se llamó “Taller de niñas”, después de su muerte este predio tuvo otras funciones, la más recordada la iniciada por el Padre Javier de Nicoló y el proyecto “Chibchalá”, hasta que en 1982, los 70 niños internos y 200 niños externos fueron llevados a la Florida, donde actualmente funciona con el programa IDIPROM.